到底用Latex还是Word写博士论文？为了这个问题纠结了很久，现在终于下定决心用Latex了。
主要的原因是Word下没有可靠的文献管理系统可用。Word内置的文献管理系统还不够成熟，没达到能够用来写博士论文的程度。Word与其它文献管理软件的结合都靠插件来实现，办公室和图书馆的公共电脑上又没有安装这些插件。另外，我对这些插件的稳定性很不放心。由于Word下实在找不到可靠的文献管理办法，因此只好用Latex。
幸运的是学校的计算机系已经有人做了博士论文的Latex模板，经过测试发现只要稍加修改就能使用。尝试了很多Latex专用编辑器，感觉都不顺手。目前对我来说最方便的方式是用Notepad++这样的文本编辑器来编写文档，然后用TexWorks来编译和调较。
因为没有光驱，折腾了许久，终于找到了不用光驱安装Linux最简单的方法。
1、用UNetbootin把下载的Linux的ISO文件刻录到一个U盘上。该U盘可启动进入完整功能的Linux，只是对系统的修改不能保存。
2、用上一步得到的U盘启动，进入图形界面后点击桌面上的安装图标即可。可以把系统安装到内置硬盘或移动硬盘上。
试过无数的个人知识管理系统，发现最好的只能是 MediaWiki。只要自己有个稳定的主机，那么用 MediaWiki 就可以架设一个在线的个人知识管理系统。MediaWiki 适合用来做认真的学习笔记，能够很方便地管理结构化半结构化的知识系统，相当于创作自己的维基百科。如果是随手记录不成体系的小技巧，那就用 Evernote 好了。另外，MediaWiki 还能用来做个人的项目管理，只要编写一些简单的模板就行了。项目中涉及的笔记和文档也尽可能直接放到维基里，可以全作成项目页面的子页面，这可比硬盘上放一堆乱七八糟的文档让人舒心多了。
MediaWiki 的厉害之处就在于其简洁的语法以及强大的模板功能。简洁的语法可以实现快速的文档编写，用几个等号就能设定标题实在太爽了。把一个门类的知识目录放在模板里，然后放到每个页面底部，就可以实现最快速的知识导航和分类。另外，MediaWiki 还有丰富的插件库可用于扩充其功能。不可能有比 MediaWiki 更简洁、灵活、而强大的知识和信息管理系统了。
P.S. 因为有大量的个人知识笔记要做，原来的教研维基不再开放，改成了私人使用。关闭前每天的访问量一百多，Alexa排名27万上下。
列个各平台常用软件对比表，为将来平台迁移做准备：
| Softwares | Windows | Linux | Mac |
|---|---|---|---|
| Acrobat | YYY | XXX | YYY |
| MS Office | YYY | XXX | YYY |
| OpenOffice | YYY | YYY | YYY |
| Dropbox | YYY | YYY | YYY |
| Firefox | YYY | YYY | YYY |
| Webdav | XXX | YYY | YYY |
| XMind | YYY | YYY | YYY |
| Sogou Pingyin | YYY | XXX | XXX |
| Thunder | YYY | XXX | XXX |
| R | YYY | YYY | YYY |
| SPSS | YYY | YYY | YYY |
| SAS | YYY | XXX | XXX |
| Kmplayer Plus | YYY | XXX | XXX |
为了让MediaWiki显示图示，尝试做了一个极简单的MediaWiki插件：Google chart。第一次做插件，呵呵。
使用很简单。比如，在MediaWiki中插入以下代码：
<chart cht=bvs chs=800x300 chbh=20,1 chxt=x,y chco=76A4FB chls=2.0 chd=t:1,2,3,6,9,13,20,28,37,49,60,72,83,92,98,100,98,92,83,72,60,49,37,28,20,13,9,6,3,2,1 />
就显示一个直方图：
rapache有个bug，网上有个ubuntu9.04的修复，文件名和9.10版不同，应该如下：
THE COMMAND:
sudo gedit /usr/share/pyshared/RapacheGtk/RapacheGui.py
INSERT THE FIX CODE AFTER LINE 78:
# HACK : work around bug @see https://bugs.launchpad.net/rapache/+bug/346788
if not Shell.command.ask_password(): sys.exit(1)
# HACK END
完了之后，用命令行运行sudo rapache。
很早前就遇到过这个bug，今天再次遭遇，终于找到解决的办法了，耶！
具体来说，就是mediawiki在解析多个list时，特别是嵌套在不同的template中的list时，可能从某个list开始就不再在解析时添加<ul>了。虽然此时解析器仍然添加<li>，但是丢失的<ul>会导致排版错乱。
摸索了半天，终于找到解决的办法。解决这个问题不是靠出问题的list，而是靠前一个list。只要在出问题的list之前的那个list的尾部添加一些让解析器工作的代码即可。为了不影响显示，只要添加一行注释就行了。
本文推荐的尽可能是免费软件，并尽可能体现“云存储”的概念，确保所有数据都能在不同的电脑上即时访问。
现在我们的工作越来越依赖于电脑，很多人往往需要在多台电脑上工作，家里的和单位里的或学校里的。最通常的做法是使用移动存储设备（移动硬盘或者U盘）将文件拷来拷去。这种做法最大的弊端是很容易造成文件的版本错乱，每个电脑硬盘上以及移动设备上都是独立的文件，时间长了你就搞不清楚哪个是最新的版本。因此有的人索性就把文件仅仅保存在移动设备里，文件的编辑也直接在移动设备上进行，这样文件就没有其他的副本，避免了版本的混乱。然而这是最最危险的做法，一旦移动硬盘损坏或丢失，所有的数据就一同丢失了。数据丢失是令人无法承受的损失，因此把数据单独存放在移动设备上是绝对不可行的方案。为了避免这一危险，经常性的备份是必要的，然而这也非常麻烦，依然无法避免文件的版本错乱。
“云存储”是现在流行的文件备份、同步与共享的一体化解决方案。其主要思想就是通过软件随时监控电脑中指定目录下的文件改动，即时将文件的变动同步到网络上的服务器中。另一方面，只要个人电脑在开机状态，软件也即时把服务器上的文件变动更新到本地的个人电脑上。举个例子，你在家里的电脑上编辑了文档，你保存后新的文档就自动更新到服务器上。当你来到单位，电脑一打开服务器上的新文档就自动下载到硬盘里了。整个过程完全自动化实现，不需要人为干预。如果你要在其它电脑（比如机房里的公共电脑、教室或会议室讲台上的演示用电脑）上打开自己的文档，也只要到网上下载就行了，不需要携带移动存储设备。
目前提供云存储服务的网站很多，这里推荐的是 Dropbox，它提供2G的免费空间（通过邀请他人使用可以免费增加到10G），足够你存储日常的工作文档了。Dropbox 还保存文档的旧版本，文档做了改动在一定时间内还能恢复到之前的版本。Dropbox 还保存了被删除的文件，可以在时间内恢复误删的文件。另外，Dropbox 还能用于文件共享，你可以设定一个目录给指定的人访问。如果要进行小组协作，大家都把文件存储在同一个共享目录里就行了，不需要用电子邮件发 来发去。
办公软件推荐使用OpenOffice.org。OpenOffice.org是一款类似于Microsoft Office的办公套件，但它是开源软件，可以免费使用。OpenOffice.org包含五个主要部件：Writer（文本处理，相当于Word）、Calc（电子表格，相当于Excel）、Impress（演示文稿，相当于Powerpoint）、Draw（作图）、Base（数据库，相当于Access）。相对于Microsoft Office来说，它少了邮件和个人信息管理软件（Outlook）以及笔记软件（Onenote），但是这两者我们有其它的替代方案。
在办公软件这块，微软的Office套件仍然是无可替代的。特别是其中的笔记软件OneNote，没有可以替代的免费软件。曾经想要推荐免费的OpenOffice.org，但是仔细斟酌之后还是推荐微软的Office。其实现在正版的Office也不贵，查到网上有149元的Office2010校园版，功能等同于专业版，可以说对学习者和研究者来说最重要的办公软件都在里面了。
对于有技术基础的，我推荐用 Mediawiki 来记笔记，用 Latex 来写工作文档。
PDF文档阅读推荐使用PDF-XChange Viewer，这是一款免费软件。它提供了基本的评阅功能，可以在PDF文件内高亮文字或插入评论框，并能保存，这些是其它免费的PDF阅读器所不具备的。
推荐使用Google提供的服务。邮件采用Gmail，它提供7G的免费空间，一般不会用完。因此没有必要把邮件下载到自己的电脑上，也就没有必要使用邮件客户端软件。日程安排使用Google Calendar，也没有必要使用专门的软件。使用在线服务的好处是在不同的电脑上可以随时访问同样的数据，免除了数据更新和同步的麻烦。
Firefox是目前最好的选择，下面的文献管理、笔记软件和网址收藏可通过插件整合于Firefox中。
目前最好的文献管理软件是Firefox的插件Zotero。Zotero提供网络存储功能，文献数据库存储在网络上，可即时在不同的电脑上访问。Zotero作为Firefox的插件，它与浏览器紧密结合，这使得从网上导入文献数据时极为方便。新的版本还提供小组合作共享功能。
对于 Latex 用户来说，JabRef 似乎是无可替代的 Bibtex 数据库管理器。
Windows平台目前最好的笔记软件是微软的OneNote。使用之前要注意在选项里修改文件的默认存储位置，把它设置到 Dropbox 的文件夹下。
目前最流行的免费笔记软件是Evernote。它有独立的客户端软件，也有Firefox的插件。它的数据也是保存在网络上，免费账号有每月使用量的限制但是足够日常的使用了。Evernote的优点是用户可以直接在网上访问自己的笔记，也可以在网上进行添加、删除、修改等各种操作。
个人认为Evernote适合用来记录零碎的知识，如果要进行结构化的知识管理还是以OneNote为宜。
对于有技术基础的，我推荐用 Mediawiki 来记笔记。
当你在不同的电脑上工作时，网页收藏夹的同步变得非常重要，云存储仍然是最好的解决方案。这里推荐的是Xmarks，它有Firefox的插件，也有IE的插件，借助插件它能够自动同步浏览器的收藏夹（Firefox里叫书签）。
提供类似服务的还有delicious、diigo等，它们都有Firefox的插件。同时使用多个服务是必要的，比如我就用Xmarks收藏日常使用的网站，用delicious收藏专业类的网站，用diigo收藏各种网页。
概念图制作软件推荐XMind。
统计分析软件推荐R。
也不知道不同的服务器上的设置到底怎么不同法，反正是一个服务器导出的，另一个服务器上就不一定能直接导入。编码是个主要问题。有的时候要自己把导出文件修改编码另存之后才能导入成功。
还和备份程序有关系，phpMyBackupPro最奇怪，居然不同的字段出现不同的编码，这是彻底没辙。更可恶的是，它自己制作的备份文件，它居然不能恢复，真是一点用都没有。还好测试了一下，没把希望寄托在它身上，否则哪天数据丢失之后发现备份档也是无用的，那真是要吐血了……
对了，还和导入程序有关系。有时候在服务商的控制面板的一键导入处不行，但是用phpmyadmin导入就行了……
一般的服务商又不开放mysqldump，这也带来不少麻烦。
Update: 有个php程序叫mysqldumper不错。
